بعد از بهینه­سازی، منومر F₂ بهینه‌شده‌ی سوم را در شش جهت مختلف به آن نزدیک نموده‌ایم. سه جهت اول طوری انتخاب شده است که مرکز ثقل منومر سوم به ترتیب روی محورهای دکارتی ، و به مرکز سیستم F₂-F₂ واقع در مرکز مختصات نزدیک می­ شود. سه جهت بین محوری نیز طوری انتخاب شده است که مرکز ثقل منومر F₂ سوم در صفحه‌ی yz روی نیم‌ساز زاویه‌ی بین محورهای y وz، در صفحه‌ی xy روی نیم‌ساز زاویه‌ی بین محور‌های و y و در صفحه‌ی xz روی نیم‌ساز زاویه‌ی بین محور‌های x و به سیستم F₂-F₂ نزدیک می‌شود.به‌عنوان مثال جهتی که منومر سوم در صفحه­ی xy روی نیم­ساز زاویه­ی بین محورهای x و y به سامانه­ی مورد بررسی نزدیک می­ شود، در شکل (۳-۱) نشان داده شده است.
بایستی ورودی­های مربوط به همه جهات را به برنامه­ی گوسین ۰۹ داده تا این­که برنامه بعد از پردازش­های لازم، خروجی مورد نظر را ایجاد نماید. موقعیت یک ذره در فضا را می توان با سه سیستم مختصات مشخص کرد. این سیستم‌ها عبارتند از سیستم‌های کارتزی، کروی و استوانه‌ای، یا در‌حقیقت هر سه پارامتر مناسب دیگری که انتخاب شده باشند برای ورود اطلاعات، از آرایه­ی z با مختصات دکارتی و یا ترکیبی از مختصات دکارتی و داخلی استفاده شده است. بدین منظور منومر سوم از فاصله­ی ۱۰ آنگسترمی مبداء مختصات دکارتی به مرکز دو منومر اولیه نزدیک شده است.

( اینجا فقط تکه ای از متن فایل پایان نامه درج شده است. برای خرید متن کامل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. )

در شکل (۳-۱) که در زیر آورده شده است، مشاهده می­ شود که در سامانه­ی مورد بررسی، دو منومر اولیه، در صفحه‌ی واقع شده ­اند.

شکل (۳-۱) هندسه­ی مورد استفاده در بررسی اثر گونه­ سوم برای نزدیک شدن منومر سوم ( منظور می­باشد) در صفحه‌ی روی نیم‌ساز زاویه­ی بین محورهای و به مرکز سیستم F₂-F₂
در این تحقیق، از رابطه­ (۳-۳) به منظور بررسی اثر گونه­ سوم در سیستم F₂-F₂ ستفاده شده است.

(۳-۲۵)

که در این رابطه

(۳-۲۶)

درنتیجه:

(۳-۲۷)

که در این رابطه انرژی مربوط به اثر گونه­ سوم، V_tot انرژی پتانسیل برهم­کنش کل سیستم، V12، V13و V23 انرژی­های پتانسیل برهم­کنش سیستم­های دیمری ۲),(۱، ۳),(۱ و ۳),(۲ و انرژی­های سیستم­های دیمری ذکر‌شده می­باشند. در این­جا شماره­های ۱ و ۲به دو منومر سیستم F₂-F₂ بهینه‌شده نسبت داده شده است و شماره­ ۳ برای منومر سوم در‌نظر گرفته شده است. E₁، E₂ و E₃به ترتیب انرژی منومر­های ۱، ۲و ۳ هستند. E₁₂₃ انرژی مجموعه­ سیستم F₂-F₂ و منومر به ازاء هر مقدار از فاصله­ی بین منومر سوم و دیمر F₂-F₂ می‌باشد.
به منظور برآورد بهتر، اثر گونه­ سوم بر روی انرژی پتانسیل برهم­کنش F₂-F₂ در سه جهت محوری در شکل (۳-۲) نمایش داده شده است.
شکل(۳-۲) انرژی مربوط به اثر گونه­ سوم ( E_INT/CM^-1 ) در جهت‌های X، Y و Z برای نزدیک شدن منومر سوم به سیستم F₂-F₂ بر حسب فاصله
با توجه به این شکل و شکل‌های (۳-۳) تا (۳-۸) که در ادامه نشان داده خواهند شد، مشاهده می­ شود که در فواصل نزدیک، جمع­پذیری جفت­گونه­ پتانسیل­ها فاقد اعتبار است، اما در فاصله­ی تقریباً ۶ آنگسترمی از مرکز سیستم F₂-F₂ که مبداء مختصات دکارتی در آن­جا واقع است، انرژی مربوط به اثر جسم سوم سیستم به‌مقدار ثابت صفر نزدیک شده و می­توان از جمع­پذیری جفت­گونه­ پتانسیل­ها استفاده نمود. به‌عنوان مثال، برای کپسول­های ۴۰۰ لیتری گاز فلوئور که در دمای ۲۹۸ کلوین، فشارشان ۵۰ اتمسفر است، فاصله­ی متوسط بین مولکول­های گاز فلوئور برابر۷۹/۵ آنگسترم می­باشد که در این شرایط، جمع­پذیری جفت­گونه­ پتانسیل­ها تقریباً معتبر می­باشد.
به دلیل این که سیستم F2-F2 در صفحه‌ی قرار دارد، وقتی که منومر سوم بر روی محور یا در صفحه به آن نزدیک می‌شود، جمع‌پذیری جفت‌گونه‌ی پتانسیل‌ها اعتبار خود را زودتر از دست می‌دهد و این بدان معنی است که در فواصل دورتر دارای اعتبار می­ شود و هنگامی که این منومر در جهت محور z یا صفحه­ی به آن نزدیک می‌شود، جمع‌پذیری جفت‌گونه­ پتانسیل‌ها اعتبار خود را تا فواصل نزدیک­تری به مرکز سیستم F2-F2 از دست نمی­دهد..
یکی از جنبه­ های بحرانی محاسبات ساختار الکترونی که ممکن است شدیداً کیفیت سطح انرژی پتانسیل محاسبه‌شده را تحت تاثیر قرار بدهد، مخصوصاً در مورد کمپلکس­های پوسته­ی باز، روش بررسی خطای پوش مجموعه‌ی پایه است. یک روش متداول برای تصحیح خطای BSSE استفاده از تصحیح آویزش بویز و برناردی است [۲۴]. لازم به ذکر است که محاسبات مربوط به جسم سوم انجام گرفته در این پایان نامه نیز نیاز به تصحیح آویزش (CP) دارند اما چون هدف مطالعه­ کیفی و یافتن یک تخمین نیمه کمی از اثر گونه­ سوم بوده و از طرف دیگر محاسبات مربوط به CP بسیار زمان­بر هستند، از انجام اصلاح صرف­نظر شده است.
اثر گونه­ سوم بر روی انرژی پتانسیل برهم‌کنش F₂-F₂ در سه جهت محوری و سه جهت بین­محوری، به­ طور جداگانه در شکل‌های (۳-۳) تا (۳-۸) نشان داده شده است
شکل(۳-۳) انرژی مربوط به اثر گونه­ سوم ( E_INT/CM^-1 ) در جهت X برای نزدیک شدن منومر سوم به سیستم F₂-F₂ بر حسب فاصله
شکل(۳-۴) انرژی مربوط به اثر گونه­ سوم ( E_INT/CM^-1 ) در جهت Y برای نزدیک شدن منومر سوم به سیستم F₂-F₂بر حسب فاصله
شکل(۳-۵) انرژی مربوط به اثر گونهِ­ی سوم ( E_INT/CM^-1 ) در جهت Z برای نزدیک شدن منومر سوم به سیستم F₂-F₂بر حسب فاصله
شکل(۳-۶) انرژی مربوط به اثر گونهِ­ی سوم ( E_INT/CM-1 ) در جهت XY برای نزدیک شدن منومر سوم به سیستم F₂-F₂ بر حسب فاصله
شکل(۳-۷) انرژی مربوط به اثر گونهِ­ی سوم ( E_INT/CM^-1 ) در جهت YZ برای نزدیک شدن منومر سوم به سیستم F₂-F₂ بر حسب فاصله
شکل(۳-۸) انرژی مربوط به اثر گونه‌ی سوم ( E_INT/CM-1 ) در جهت XZ برای نزدیک شدن منومر سوم به سیستم F₂-F₂ بر حسب فاصله
در ادامه به منظور مقایسه­ بهتر، نتایج اثر گونه­ سوم سیستم F₂-F₂ گاز فلوئور که با روش MP2/aug-cc-pVTZ توسط نوری و با روش MP2/ 631G* توسط نوربالا صورت گرفته، آورده شده است.
نتیجه­ محاسبات انجام‌شده توسط نوری از مجموعه پایه aug-cc-pVTZ در سطح نظری MP2، در شکل‌های (۳-۹) تا (۳-۱۴) آورده شده است.

شکل (۳-۹) انرژی مربوط به اثر گونه‌ی سوم برای نزدیک شدن منومر سوم بر روی محور X به سیستم F₂-F₂ به‌عنوان تابعی از ]۵۵[.