۸۴/۱ ± ۳۳/۲۷ b
C
۳۷/۱ ± ۷۱/۲۵ d
D
۴۳/۱ ± ۵۲/۳۰ a
E
c ۹۵/۲ ± ۳۹/۲۳
F
d ۲۱/۴ ± ۶۷/۲۶
G
۶۲/۳ ± ۳۱/۲۲ d
H
۴۱/۲ ± ۰۳/۲۴ c
* میانگین‌های دارای حروف یکسان فاقد تفاوت معنی دار آماری (p< 0.05) هستند.
۴-۵ تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک
۴-۵-۱ توالی یابی
جهت بررسی بیشتر و تایید چند شکلی در جایگاه ژن هورمون رشد GH-2 ماهی سفید تکثیر شده از هر الگوی باندی یک نمونه برای تعیین توالی ارسال شد. نتیجه توالی نمونه‌ها در شکل ۴-۶ آمده است. نتایج تعیین توالی علاوه بر تایید قطعه مورد نظر، نشان داد که در الگوی باندی C نه SNP به صورت چند شکلی‌های T به G در ناحیه ۸۲ جفت بازی، A به C در ناحیه ۱۱۳ جفت بازی، G به A در ناحیه ۲۰۷ جفت بازی، G به A در ناحیه ۲۵۴ جفت بازی، G به A در ناحیه ۲۶۹ جفت بازی، G به A در ناحیه ۲۹۶ جفت بازی، A به G در ناحیه ۳۰۷ جفت بازی، C به A در ناحیه ۳۰۸ جفت بازی و G به A در ناحیه ۳۴۶ جفت بازی قطعه تکثیر شده رخ داده است. همچنین در ناحیه ۳۶۶ جفت بازی در الگوی باندی B یک جهش از نوع حذف مشاهده شد. این SNP ها در مقایسه با الگوی باندی A ماهی سفید است (شکل ۴-۷) (نمودار ۴-۱). همچنین توالی به دست آمده از ماهی سفید با توالی‌های ثبت شده از دیگر ماهیان خانواده کپور در بانک ژنی[۶۳] BLAST شد که درصد هم‌پوشانی آن‌ها در پیوست آمده است. به دلیل یکسان بودن درصدهای هم‌پوشانی توالی هر سه الگوی باندی فقط یک نمونه از آن آورده شده است.
( اینجا فقط تکه ای از متن درج شده است. برای خرید متن کامل فایل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. )
۴-۵-۲ مقایسه توالی GH-2 ماهی سفید و ماهی کپور معمولی
توالی الگوهای باندی مشاهده شده در جایگاه GH-2 ماهی سفید با توالی ثبت شده از ماهی کپور معمولی مورد مقایسه قرار گرفت که نتایج آن در شکل ۴-۷ آمده است.
توالی الگوی باندی C:
GGAAGCTTAACCCCAACCAGCTCACTGAGAAGGGCATCANCGTGCTCATCAAGGTGAGAGAGATCCGATTTATTCTAGGCTACTTTCGTTTTTTTTTAAACAATGTGTCTAGGGGTCGTATCAGGAGGTGTGATGACATCTTCCCATCTTGTGGGCTTATTTGGATAGCTATTCCATAATTTGCCATTTGTATCTGCACAGGGATGTCTGGATGGTCAACCAAACATGGATGATAACAACTCCCTACCGCTGCCTTTTGAGGATTTCTACTTGACCATGGGGGAAAGCAGCGTCAGAGAAAGCTTCCGTCTTCTGGCTTGCTTCAAAAAGGACATGCGAAAGGTGGAAACTTACCTGAGGGTTGCAAATTGCAGGAAATCCCTGGATTCCAACTGCACCCTGTAGA
توالی الگوی باندی B:
GGAAGCTTAACCCCAACCAGCTCACTGAGAAGGGCATCAGCGTGCTCATCAAGGTGAGAGAGATCCGATTTATTCTAGGCTACTTTCGTTTTTTTTTAAACAATGTGTCTAGTGGTCGTATCAGGAGGTGTGATGACATCTTCACATCTTGTGGGCTTATTTGGATAGCTATTCCATAATTTGCCATTTGTATCTGCACAGGGATGTCTGGATGGTCAACCAAACATGGATGATAACGACTCCCTACCGCTGCCTTTTGAGGATTTCTACTTGACCATGGGGGAGAGCAGCGTCAGAGAGAGCTTCCGTCTTCTGGCTTGCTTCAAGAAGGACATGCACAAGGTGGAAACTTACCTGAGGGTTGCAAATTGCAGGAGATCCCTGGATTCCAACTGCCCCTGTAGA
توالی الگوی باندی A:
GGAAGCTTAACCCCAACCAGCTCACTGAGAAGGGCATCAGCGTGCTCATCAAGGTGAGAGAGATCCGATTTATTCTAGGCTACTTTCGTTTTTTTTTAAACAATGTGTCTAGTGGTCGTATCAGGAGGTGTGATGACATCTTCACATCTTGTGGGCTTATTTGGATAGCTATTCCATAATTTGCCATTTGTATCTGCACAGGGATGTCTGGATGGTCAACCAAACATGGATGATAACGACTCCCTACCGCTGCCTTTTGAGGATTTCTACTTGACCATGGGGGAGAGCAGCGTCAGAGAGAGCTTCCGTCTTCTGGCTTGCTTCAAGAAGGACATGCACAAGGTGGAAACTTACCTGAGGGTTGCAAATTGCAGGAGATCCCTGGATTCCAACTGCACCCTGTAGA
شکل ۴-۶ مقابسه توالی‌ها بین نمونه‌های ماهی سفید با ژنوتیپ دارای الگوهای باندی A، B و C
شکل ۴-۷ هم ترازی سه نمونه ارسال شده ماهی سفید برای توالی یابی.
فلش‌های آبی نشان دهنده قسمت‌های جهش یافته در الگوی باندی C و B نسبت به الگوی باندی A هستند و فلش‌های قرمز تفاوت الگوهای باندی ماهی سفید را با توالی ماهی کپور معمولی نشان می‌دهد. نمونه ۶۶، ۴ و ۱ به ترتیب الگوهای باندی A، B و C هستند. همچنین Accession number، EU340137 مربوط به توالی GH-2 کپور معمولی است.
